2001年開通的廈金航線，只是廈門對臺交流合作先行先試的一個縮影。而廈門在兩岸交流合作中扮演開拓者角色，得益于經濟特區(qū)的設立和中央政府賦予歷史重任。1989年，經國務院批準，大陸第一個臺商投資區(qū)在廈門海滄成立；隨后，廈門杏林、集美兩個臺商投資區(qū)先后誕生。至今，大陸四大國家級臺商投資區(qū)，廈門有其三。

設立臺商投資區(qū)之后，廈門充分利用所享有的經濟特區(qū)立法權，在大陸率先頒布施行地方性法規(guī)《臺商投資保護條例》，并在大陸第一個成立臺商協會和臺商會館，設立臺商投訴中心，為臺商在廈投資興業(yè)、安居樂業(yè)創(chuàng)造良好環(huán)境。